Porto Tolle liegt zwischen den Poarmen Po di Maistra und Po di Gnocca eingeschlossen und wird vom Po di Venezia in zwei Hälften geschnitten. Diese Flussarme bilden so drei Inseln: die Insel Cà Venier, die Insel Donzella und die Insel Polesine Camerini.
Das Gebiet um Porto Tolle ist einzigartig und zeichnet sich durch Sümpfe, "Sandbänke", kleine Buchten, "Bänke", Inseln mit noch unberührten Sandstränden, verzweigte Flussarme, Auen, Nischen und Lagunen aus, zu denen auch die faszinierende und wunderschöne Bucht Sacca degli Scardovari zählt. Letztere bildet den idealen Lebensraum für die berühmten DOP-Muscheln von Scardovari, die hier einen der intensivsten Brutplätze finden. An der Straße, welche die Bucht entlang verläuft und die man auch mit dem Fahrrad zurücklegen kann, kann man die verschiedenen Phasen der Aquakultur genauer beobachten.
Zu all dem kommt noch das interessanteste Merkmal hinzu: Hier befindet man sich im Durchschnitt 2 Meter unter dem Meeresspiegel, hin und wieder sogar 4 Meter! Man ist daher umgeben von hohen Deichen, die zum Teil eine Art natürliches Amphitheater bilden und das Festland vom Wasser trennen, um Überflutungen durch den Po zu vermeiden.